一般地，在中大陆地区的教科书中，均将微生物划分为以下8大类：细菌、病、真菌、放线菌、立克次体、支原体、衣原体、螺旋体。种类——原核：细菌微生物的种类有：细菌、病、真菌、放线菌、立克次氏体、支原体、衣原体、螺旋体。微生物就是肉眼难以看清，需要借助学显微镜或电子显微镜才能观察
微生物主要分为以下几类：(更详细与严谨的分类请参阅微生物分类表) 原核微生物细菌(Bacteria) 古菌(Archaea) 真核微生物真菌(fungus) 霉菌酵母担子菌原生动物(protozoan) 藻类(algae) 无细胞生物病(virus)微生物有各种形状、大小和颜色，它们有的像圆球，有的像圆柱，还有些是螺旋形的。其中有5类最常见的微生物细菌(如球菌、杆菌、螺旋菌、弧菌);真菌(如接合菌、囊子菌);藻类(如硅藻、腰鞭毛虫);病(如腺病、噬菌体)和原生动物(如阿米巴原虫、草履虫)。这只是微生物中的几个常见种类，每个种类里，又有许多不同的微生物，有些是由一个细胞构成的，另外一些是由多个细胞构成的，但它们也很小，必须用显微镜才能看见。
微生物的分类依据：形态特征、生理生化特征、生态习性、清学反应、噬菌反应、细胞壁成分、红外吸收谱、GC含量、DNA杂合率、核糖体核糖酸(rRNA )相关度、rRNA的碱基顺序。微生物的分类，主要包括：细菌、病、真菌等三种。细菌：一类细胞细短，结构简单，胞壁坚韧，多以二分裂方式繁殖和水生性强的原核生物。病：一类由
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